Nuo pandemijos pradžios diagnostiniai tyrimai suvaidino gyvybiškai svarbų vaidmenį kontroliuojant SARS-CoV-2, viruso, sukeliančioCOVID 19.Greiti antigenų tyrimaiatlikus namuose arba klinikinėje aplinkoje, rezultatai gaunami per 15 minučių ar mažiau.Kuo anksčiau žmogui diagnozuojama, tuo greičiau jis gali kreiptis į medikus ir atsiriboti nuo kitų.Tačiau kai atsiranda naujų viruso variantų, šie variantai gali būti neaptikti šiais tyrimais.
Dauguma greitųjų antigenų testų yra skirti SARS-CoV-2 nukleokapsidės baltymui arba N-baltymui aptikti.Šio baltymo gausu virusų dalelėse ir užsikrėtusiuose žmonėse.Greito testo rinkinyss paprastai turi du skirtingus diagnostinius antikūnus, kurie jungiasi prie skirtingų N baltymo dalių.Kai antikūnas prisijungia prie N baltymo mėginyje, ant tyrimo rinkinio atsiranda spalvota linija arba kitas signalas, nurodantis infekciją.
Baltymas N susideda iš 419 aminorūgščių struktūrinių vienetų.Bet kuri iš jų mutacijos būdu gali būti pakeista kita aminorūgštimi.Mokslinių tyrimų grupė, vadovaujama Ph.D.Philipas Frankas ir Ericas Ortlundas iš Emory universiteto nusprendė ištirti, kaip šis vienintelis aminorūgščių pokytis veikia greitojo antigeno tyrimo našumą.Jie naudojo metodą, vadinamą giliųjų mutacijų nuskaitymu, kad tuo pačiu metu įvertintų, kaip kiekviena viruso N baltymo mutacija veikia prisijungimą prie diagnostinio antikūno.Jų rezultatai buvo paskelbti Cell 2022 m. rugsėjo 15 d.
Tyrėjai sukūrė išsamią beveik 8000 N baltymų mutacijų biblioteką.Šie variantai sudaro daugiau nei 99,5% visų galimų mutacijų.Tada jie įvertino, kaip kiekvienas variantas sąveikauja su 17 skirtingų diagnostinių antikūnų, naudojamų atliekant 11 komerciškai prieinamų greitųjų antigenų testų, įskaitant bendrusnamų rinkiniai.
Grupė įvertino, kurios N-baltymų mutacijos turi įtakos antikūnų atpažinimui.Remdamiesi šia informacija, jie sukūrė „pabėgimo mutacijos profilį“ kiekvienam diagnostiniam antikūnui.Šis profilis nustato specifines N baltymo mutacijas, kurios gali turėti įtakos antikūno gebėjimui prisijungti prie savo taikinio.Analizė parodė, kad šiuolaikiniuose greituosiuose tyrimuose naudojami antikūnai atpažįsta ir suriša visus buvusius ir esamus SARS-CoV-2 variantus, keliančius susirūpinimą ir susirūpinimą.
Nors keli diagnostiniai antikūnai atpažįsta tą patį N baltymo regioną, mokslininkai nustatė, kad kiekvienas antikūnas turi unikalų pabėgimo mutacijų požymį.Kadangi SARS-CoV-2 virusas ir toliau mutuoja ir generuoja naujus variantus, šie duomenys gali būti naudojami norint pažymėti testo rinkinio antikūnus, kuriuos gali tekti įvertinti iš naujo.
„Tikslus ir veiksmingas užkrėstų asmenų identifikavimas išlieka svarbia COVID-19 mažinimo strategija, o mūsų tyrimas suteikia informacijos apie būsimas SARS-CoV-2 mutacijas, kurios gali trukdyti aptikti“, – sakė Ortlundas.„Čia pateikti rezultatai leidžia mums greitai prisitaikyti prie šio viruso, nes ir toliau atsiranda naujų variantų, turinčių tiesioginių klinikinių ir visuomenės sveikatos pasekmių.
Pagrindinė informacija: Mutation Deep Scan aptinka pabėgimo mutacijas SARS-CoV-2 nukleokapsidėje, naudodamas šiuo metu turimus greituosius antigenų tyrimus.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cell.2022 m. rugsėjo 15 d.;185(19):3603-3616.e13.Vidaus reikalų ministerija: 10.1016/j.cell.2022.08.010.2022 m. rugpjūčio 29 d. PMID: 36084631.
Finansavimas: Nacionalinis biomedicininio vaizdo ir bioinžinerijos institutas NIH (NIBIB), Nacionalinis diabeto, virškinimo ir inkstų ligų institutas (NIDDK) ir Nacionalinis alergijos ir infekcinių ligų institutas (NIAID), Amerikos širdies asociacija.
„NIH Research Matters“ yra kas savaitę atnaujinamas NIH ekspertų peržiūrimas pagrindinių NIH tyrimų išvadų.Ją skelbia Nacionalinių sveikatos institutų direktoriaus Komunikacijos ir viešųjų reikalų biuras.